MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus cereus E33L plasmid pE33L9

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007107	A	7	7	688	694	100 %	0 %	0 %	0 %	67078391
2	NC_007107	CATTTT	2	12	734	745	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	67078391
3	NC_007107	TAAA	2	8	773	780	75 %	25 %	0 %	0 %	67078391
4	NC_007107	CTA	2	6	782	787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078391
5	NC_007107	AAT	2	6	823	828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078391
6	NC_007107	TGG	3	9	894	902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67078391
7	NC_007107	AGT	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078391
8	NC_007107	AAG	2	6	960	965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078391
9	NC_007107	GGA	2	6	994	999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67078391
10	NC_007107	TTG	2	6	1025	1030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67078391
11	NC_007107	AATC	2	8	1045	1052	50 %	25 %	0 %	25 %	67078391
12	NC_007107	A	6	6	1067	1072	100 %	0 %	0 %	0 %	67078391
13	NC_007107	TA	3	6	1076	1081	50 %	50 %	0 %	0 %	67078391
14	NC_007107	ACTTT	2	10	1111	1120	20 %	60 %	0 %	20 %	67078391
15	NC_007107	TAT	2	6	1189	1194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078391
16	NC_007107	TAAAA	2	10	1195	1204	80 %	20 %	0 %	0 %	67078391
17	NC_007107	GCA	2	6	1825	1830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67078392
18	NC_007107	TCA	2	6	1834	1839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078392
19	NC_007107	AATC	2	8	2172	2179	50 %	25 %	0 %	25 %	67078393
20	NC_007107	AAG	2	6	2311	2316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078393
21	NC_007107	TGA	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078393
22	NC_007107	CTA	2	6	2369	2374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078393
23	NC_007107	GAC	2	6	2445	2450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67078393
24	NC_007107	A	6	6	2469	2474	100 %	0 %	0 %	0 %	67078393
25	NC_007107	ATG	3	9	2548	2556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078393
26	NC_007107	AGT	2	6	2601	2606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078393
27	NC_007107	GCA	2	6	2645	2650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67078393
28	NC_007107	GA	3	6	2693	2698	50 %	0 %	50 %	0 %	67078393
29	NC_007107	ATT	2	6	2823	2828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078393
30	NC_007107	AAGAAA	2	12	2842	2853	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	67078393
31	NC_007107	GATT	2	8	2867	2874	25 %	50 %	25 %	0 %	67078393
32	NC_007107	A	6	6	2882	2887	100 %	0 %	0 %	0 %	67078393
33	NC_007107	GAATTA	2	12	2907	2918	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67078393
34	NC_007107	TGT	2	6	2942	2947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67078393
35	NC_007107	AGT	2	6	2969	2974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078393
36	NC_007107	ACA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67078393
37	NC_007107	AG	3	6	2987	2992	50 %	0 %	50 %	0 %	67078393
38	NC_007107	TGAAAA	2	12	2993	3004	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67078393
39	NC_007107	A	6	6	3040	3045	100 %	0 %	0 %	0 %	67078393
40	NC_007107	AGT	3	9	3131	3139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078393
41	NC_007107	GAA	2	6	3179	3184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078393
42	NC_007107	AACAA	2	10	3230	3239	80 %	0 %	0 %	20 %	67078393
43	NC_007107	AGAC	2	8	3286	3293	50 %	0 %	25 %	25 %	67078393
44	NC_007107	TGCA	2	8	3322	3329	25 %	25 %	25 %	25 %	67078393
45	NC_007107	GAAA	2	8	3341	3348	75 %	0 %	25 %	0 %	67078393
46	NC_007107	A	6	6	3367	3372	100 %	0 %	0 %	0 %	67078393
47	NC_007107	AAG	2	6	3385	3390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078393
48	NC_007107	TGTA	2	8	3463	3470	25 %	50 %	25 %	0 %	67078393
49	NC_007107	A	6	6	3477	3482	100 %	0 %	0 %	0 %	67078393
50	NC_007107	ATT	2	6	3516	3521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078393
51	NC_007107	A	6	6	3573	3578	100 %	0 %	0 %	0 %	67078393
52	NC_007107	TGGAT	2	10	3596	3605	20 %	40 %	40 %	0 %	67078393
53	NC_007107	A	8	8	3843	3850	100 %	0 %	0 %	0 %	67078394
54	NC_007107	TTA	2	6	3851	3856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078394
55	NC_007107	A	7	7	3872	3878	100 %	0 %	0 %	0 %	67078394
56	NC_007107	AAAG	2	8	3883	3890	75 %	0 %	25 %	0 %	67078394
57	NC_007107	GTG	2	6	3932	3937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67078394
58	NC_007107	GAA	3	9	3946	3954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078394
59	NC_007107	TGC	2	6	3965	3970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67078394
60	NC_007107	TGG	2	6	3990	3995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67078394
61	NC_007107	AGA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078394
62	NC_007107	A	6	6	4021	4026	100 %	0 %	0 %	0 %	67078394
63	NC_007107	ATT	2	6	4073	4078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078394
64	NC_007107	TTG	2	6	4163	4168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67078394
65	NC_007107	A	7	7	4169	4175	100 %	0 %	0 %	0 %	67078394
66	NC_007107	ATG	2	6	4181	4186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078394
67	NC_007107	ATG	2	6	4261	4266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078394
68	NC_007107	TAA	2	6	4313	4318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078394
69	NC_007107	AT	3	6	4367	4372	50 %	50 %	0 %	0 %	67078394
70	NC_007107	GAT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078394
71	NC_007107	CAA	2	6	4411	4416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67078394
72	NC_007107	T	6	6	4418	4423	0 %	100 %	0 %	0 %	67078394
73	NC_007107	TAA	2	6	4455	4460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078394
74	NC_007107	A	6	6	4462	4467	100 %	0 %	0 %	0 %	67078394
75	NC_007107	ATTT	3	12	4480	4491	25 %	75 %	0 %	0 %	67078394
76	NC_007107	ATA	2	6	5150	5155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078395
77	NC_007107	A	6	6	5177	5182	100 %	0 %	0 %	0 %	67078395
78	NC_007107	GAAA	2	8	5221	5228	75 %	0 %	25 %	0 %	67078395
79	NC_007107	ATG	2	6	5254	5259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078395
80	NC_007107	GAT	2	6	5284	5289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078395
81	NC_007107	AGA	2	6	5319	5324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078395
82	NC_007107	CAT	2	6	5358	5363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078395
83	NC_007107	T	6	6	5413	5418	0 %	100 %	0 %	0 %	67078395
84	NC_007107	TTA	2	6	5421	5426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078395
85	NC_007107	CAT	2	6	5471	5476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078395
86	NC_007107	A	7	7	5493	5499	100 %	0 %	0 %	0 %	67078395
87	NC_007107	AAT	2	6	5503	5508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078395
88	NC_007107	GTAA	2	8	5554	5561	50 %	25 %	25 %	0 %	67078395
89	NC_007107	A	8	8	5575	5582	100 %	0 %	0 %	0 %	67078395
90	NC_007107	ATT	2	6	5586	5591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078395
91	NC_007107	TTTA	2	8	5639	5646	25 %	75 %	0 %	0 %	67078395
92	NC_007107	TCTA	2	8	5758	5765	25 %	50 %	0 %	25 %	67078396
93	NC_007107	T	6	6	5767	5772	0 %	100 %	0 %	0 %	67078396
94	NC_007107	AGA	2	6	5803	5808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078396
95	NC_007107	AAG	2	6	5821	5826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078396
96	NC_007107	GCT	2	6	5827	5832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67078396
97	NC_007107	CTG	2	6	5840	5845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67078396
98	NC_007107	CAAT	2	8	5863	5870	50 %	25 %	0 %	25 %	67078396
99	NC_007107	CAT	2	6	5873	5878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078396
100	NC_007107	ATT	2	6	5977	5982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078396
101	NC_007107	T	6	6	5981	5986	0 %	100 %	0 %	0 %	67078396
102	NC_007107	TAA	2	6	6009	6014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078396
103	NC_007107	CTTT	2	8	6152	6159	0 %	75 %	0 %	25 %	67078396
104	NC_007107	TCTT	2	8	6162	6169	0 %	75 %	0 %	25 %	67078396
105	NC_007107	T	7	7	6168	6174	0 %	100 %	0 %	0 %	67078396
106	NC_007107	A	6	6	6186	6191	100 %	0 %	0 %	0 %	67078396
107	NC_007107	TA	3	6	6684	6689	50 %	50 %	0 %	0 %	67078397
108	NC_007107	AGG	2	6	6762	6767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67078397
109	NC_007107	GAA	2	6	6850	6855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078397
110	NC_007107	GACAT	2	10	6863	6872	40 %	20 %	20 %	20 %	67078397
111	NC_007107	GAA	2	6	6956	6961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078397
112	NC_007107	TAC	2	6	7035	7040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078397
113	NC_007107	ATT	2	6	7099	7104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078397
114	NC_007107	GAA	2	6	7171	7176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078397
115	NC_007107	TGA	2	6	7186	7191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078397
116	NC_007107	AAG	2	6	7229	7234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078397
117	NC_007107	AAT	2	6	7278	7283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078397
118	NC_007107	AT	3	6	7606	7611	50 %	50 %	0 %	0 %	67078398
119	NC_007107	TCT	2	6	7629	7634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67078398
120	NC_007107	TTAT	2	8	7635	7642	25 %	75 %	0 %	0 %	67078398
121	NC_007107	AT	3	6	7647	7652	50 %	50 %	0 %	0 %	67078398
122	NC_007107	TGTT	2	8	7712	7719	0 %	75 %	25 %	0 %	67078398
123	NC_007107	GGAA	2	8	7847	7854	50 %	0 %	50 %	0 %	67078398
124	NC_007107	TAT	2	6	7864	7869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078398
125	NC_007107	TCA	2	6	7896	7901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078398
126	NC_007107	TTCT	2	8	7928	7935	0 %	75 %	0 %	25 %	67078398
127	NC_007107	CTT	2	6	7945	7950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67078398
128	NC_007107	TAT	2	6	7988	7993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078398
129	NC_007107	TCAC	2	8	8019	8026	25 %	25 %	0 %	50 %	67078398
130	NC_007107	AACAA	2	10	8403	8412	80 %	0 %	0 %	20 %	67078399
131	NC_007107	TTA	2	6	8438	8443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078399
132	NC_007107	AAT	2	6	8456	8461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078399
133	NC_007107	TAATTT	2	12	8502	8513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078399
134	NC_007107	TATT	2	8	8529	8536	25 %	75 %	0 %	0 %	67078399
135	NC_007107	AAATA	2	10	8592	8601	80 %	20 %	0 %	0 %	67078399

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.